Byl český reformovaný kazatel a zakladatel diakonické práce na území dnešní České republiky. Působil ve sborech ve Vtelně, v Černilově (1850-1859), v Praze u Klimenta (1859-1862) a v Krabčicích v letech 1862 až 1885.
Roku 1861 založil periodikum Hlasy ze Siona, o rok později založil časopis Hus. Od roku 1870 vydával časopis pro vnitřní misii nazvaný Evangelické listy. Inspirován diakonickým ústavem v německém Kasierswerthu, založil v roce 1864 v Krabčicích evangelický dětský ústav, sirotčinec a nedělní školu - první v Českém království. Datum 1. 11. 1864 je zároveň označením vzniku první diakonické (charitativní) práce u nás.
Roku 1874 stál u zrodu diakonické organizace, jež byla nazvána Evangelická společnost pro dobročinnost křesťanskou (pod názvem Českobratrská společnost pro dobročinnost křesťanskou existovala až do roku 1951).
byl český reformovaný, po roce 1918 českobratrský evangelický farář. V krabčickém sboru působil po dokončení studií mezi lety 1875 a 1877, přesto je tento relativně krátký pobyt významný. Právě v Krabčicích totiž začal psát svou nejznámnější knihu Broučci. Dokončil ji však až po několikaletých úpravách a roku 1876 anonymně vydal v Růžďce na Vsetínsku. S uvedením autorova jména byla poprvé otištěna až v roce 1894.
Jeho působení v Krabčicích dodnes dokládá tzv. Karafiátův dům, který je součástí Diakonie ČCE.